Het is nog niet helemaal duidelijk wat de beste aanpak is om nieuwe aanvallen van MOGAD te voorkomen. Soms kiest de neuroloog ervoor om na een eerste aanval al een behandeling op te starten om het afweersysteem te onderdrukken, maar vaker wordt gewacht totdat er een tweede aanval optreedt. Na een periode van enkele jaren zonder aanvallen zet een neuroloog de afweeronderdrukkende behandeling vaak stop om de bijwerkingen van dit soort medicatie op lange termijn te beperken.
Afweeronderdrukkende medicijnen, zoals rituximab, azathioprine en mycofenolaatmofetil, lijken matig effectief. Andere behandelingen zoals tocilizumab of intraveneuze immuunglobulines lijken effectiever op basis van observationeel onderzoek, maar worden in België niet standaard terugbetaald. Nieuwe behandelingen zijn nog in de onderzoeksfase.
De keuze voor een preventieve behandeling hangt af van de klachten en het eerdere ziekteverloop en maakt de persoon met MOGAD in samenspraak met de behandelend neuroloog.